Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpv1Q704Y3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpv1Q704Y3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpv1Q704Y3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpv1Q704Y3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpv1Q704Y3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trpv1Q704Y3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1977.6 ms