Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube2r2Q6ZWZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube2r2Q6ZWZ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube2r2Q6ZWZ2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2r2Q6ZWZ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2r2Q6ZWZ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2r2Q6ZWZ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.2 ms