Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup188Q6ZQH8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nup188Q6ZQH8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Nup188Q6ZQH8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nup188Q6ZQH8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nup188Q6ZQH8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nup188Q6ZQH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms