Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ03

Fnbp4, Formin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnbp4Q6ZQ03 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Fnbp4Q6ZQ03 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fnbp4Q6ZQ03 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fnbp4Q6ZQ03 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fnbp4Q6ZQ03 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fnbp4Q6ZQ03 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fnbp4Q6ZQ03 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms