Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sbf1Q6ZPE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sbf1Q6ZPE2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sbf1Q6ZPE2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sbf1Q6ZPE2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbf1Q6ZPE2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sbf1Q6ZPE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sbf1Q6ZPE2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbf1Q6ZPE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbf1Q6ZPE2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbf1Q6ZPE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sbf1Q6ZPE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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