Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssxb3Q6XAS4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssxb3Q6XAS4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssxb3Q6XAS4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ssxb3Q6XAS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssxb3Q6XAS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms