Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt9Q6RHW0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt9Q6RHW0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt9Q6RHW0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms