Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cacna2d2Q6PHS9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d2Q6PHS9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d2Q6PHS9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms