Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Snx13Q6PHS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx13Q6PHS6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx13Q6PHS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx13Q6PHS6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx13Q6PHS6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx13Q6PHS6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms