Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HjurpQ6PG16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HjurpQ6PG16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HjurpQ6PG16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HjurpQ6PG16 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms