Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sarm1Q6PDS3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sarm1Q6PDS3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sarm1Q6PDS3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sarm1Q6PDS3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms