Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd13aQ6PDE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd13aQ6PDE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mfsd13aQ6PDE8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms