Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAC4

Uncharacterized protein C2orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PAC4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6PAC4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6PAC4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6PAC4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6PAC4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6PAC4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6PAC4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6PAC4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6PAC4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6PAC4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6PAC4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q6PAC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q6PAC4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms