Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hmgb4Q6P8W9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hmgb4Q6P8W9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hmgb4Q6P8W9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms