Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2d40Q6P8N9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2d40Q6P8N9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp2d40Q6P8N9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.1 ms