Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BC061212Q6P8K3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BC061212Q6P8K3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BC061212Q6P8K3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BC061212Q6P8K3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms