Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc148Q6P5U8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc148Q6P5U8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc148Q6P5U8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc148Q6P5U8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc148Q6P5U8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms