Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx19Q6P4T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx19Q6P4T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx19Q6P4T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx19Q6P4T1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx19Q6P4T1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms