Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hdac4Q6NZM9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac4Q6NZM9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac4Q6NZM9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac4Q6NZM9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac4Q6NZM9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms