Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rprd2Q6NXI6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rprd2Q6NXI6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rprd2Q6NXI6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rprd2Q6NXI6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rprd2Q6NXI6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms