Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS65

Gpr17, Uracil nucleotide/cysteinyl leukotriene receptor, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr17Q6NS65 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr17Q6NS65 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr17Q6NS65 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr17Q6NS65 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpr17Q6NS65 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpr17Q6NS65 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr17Q6NS65 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr17Q6NS65 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpr17Q6NS65 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms