Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Capn11Q6J756 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn11Q6J756 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn11Q6J756 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn11Q6J756 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms