Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt77Q6IFZ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt77Q6IFZ6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt77Q6IFZ6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.8 ms