Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt42Q6IFX2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt42Q6IFX2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt42Q6IFX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt42Q6IFX2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt42Q6IFX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms