Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lemd2Q6DVA0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lemd2Q6DVA0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lemd2Q6DVA0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lemd2Q6DVA0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lemd2Q6DVA0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms