Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scaf8Q6DID3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scaf8Q6DID3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Scaf8Q6DID3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scaf8Q6DID3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Scaf8Q6DID3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scaf8Q6DID3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms