Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep290Q6A078 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep290Q6A078 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cep290Q6A078 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep290Q6A078 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep290Q6A078 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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