Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prex1Q69ZK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Prex1Q69ZK0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Prex1Q69ZK0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Prex1Q69ZK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Prex1Q69ZK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Prex1Q69ZK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Prex1Q69ZK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Prex1Q69ZK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prex1Q69ZK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms