Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37,55■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC37,52■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Samd9lQ69Z37 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,5■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC37,49■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37,46■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Samd9lQ69Z37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,58
Samd9lQ69Z37 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC37,36■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37,34■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,33■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Samd9lQ69Z37 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37,32■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37,29■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37,28■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37,27■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Samd9lQ69Z37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Samd9lQ69Z37 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37,19■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37,13■■■■□ 3,54
Samd9lQ69Z37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Samd9lQ69Z37 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms