Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp4Q68FH0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp4Q68FH0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp4Q68FH0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp4Q68FH0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkp4Q68FH0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms