Protein–RNA interactions for Protein: Q64345

Ifit3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3Q64345 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit3Q64345 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit3Q64345 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifit3Q64345 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifit3Q64345 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms