Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nhlh2Q64221 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nhlh2Q64221 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms