Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccpg1Q640L3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccpg1Q640L3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccpg1Q640L3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccpg1Q640L3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccpg1Q640L3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms