Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab34Q64008 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab34Q64008 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab34Q64008 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rab34Q64008 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms