Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itga3Q62470 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga3Q62470 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga3Q62470 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga3Q62470 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga3Q62470 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms