Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20854Q62461 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20854Q62461 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20854Q62461 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms