Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm20917Q62457 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Gm20917Q62457 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm20917Q62457 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Gm20917Q62457 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gm20917Q62457 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gm20917Q62457 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm20917Q62457 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm20917Q62457 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20917Q62457 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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