Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Supt6hQ62383 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Supt6hQ62383 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Supt6hQ62383 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Supt6hQ62383 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Supt6hQ62383 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Supt6hQ62383 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Supt6hQ62383 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms