Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sos1Q62245 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sos1Q62245 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sos1Q62245 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sos1Q62245 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sos1Q62245 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sos1Q62245 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms