Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six1Q62231 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six1Q62231 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six1Q62231 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six1Q62231 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Six1Q62231 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six1Q62231 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Six1Q62231 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Six1Q62231 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Six1Q62231 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Six1Q62231 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms