Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ttf1Q62187 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ttf1Q62187 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ttf1Q62187 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ttf1Q62187 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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Ttf1Q62187 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ttf1Q62187 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf1Q62187 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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