Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lama3Q61789 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lama3Q61789 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lama3Q61789 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lama3Q61789 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lama3Q61789 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama3Q61789 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms