Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itm2aQ61500 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2aQ61500 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2aQ61500 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2aQ61500 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms