Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rev3lQ61493 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rev3lQ61493 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rev3lQ61493 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rev3lQ61493 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rev3lQ61493 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 896.7 ms