Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncor1Q60974 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncor1Q60974 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ncor1Q60974 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncor1Q60974 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncor1Q60974 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms