Protein–RNA interactions for Protein: Q60775

Elf1, ETS-related transcription factor Elf-1, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf1Q60775 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Elf1Q60775 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Elf1Q60775 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Elf1Q60775 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Elf1Q60775 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Elf1Q60775 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Elf1Q60775 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elf1Q60775 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elf1Q60775 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Elf1Q60775 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms