Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cldn11Q60771 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn11Q60771 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cldn11Q60771 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn11Q60771 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn11Q60771 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms