Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
PtprnQ60673 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22,52■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
PtprnQ60673 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22,51■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,46■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,19
PtprnQ60673 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22,44■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22,42■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22,41■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22,4■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
PtprnQ60673 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,37■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22,37■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
PtprnQ60673 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,8 ms