Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sik1Q60670 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sik1Q60670 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sik1Q60670 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sik1Q60670 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sik1Q60670 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms