Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2aQ60648 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm2aQ60648 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm2aQ60648 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms